Complete mitochondrial genome of the California halibut, Paralichthys californicus

The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work presents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina platform. Reads were cleaned, trim...

Deskribapen osoa

Gorde:

Xehetasun bibliografikoak
Egile Nagusiak:	Vargas-Peralta, Carmen E, Farfán, Claudia, Lafarga-De La Cruz, Fabiola, Barón-Sevilla, Benjamín, Del Río-Portilla, Miguel A
Formatua:	info:eu-repo/semantics/article
Hizkuntza:	eng
Argitaratua:	Iniversidad Autónoma de Baja California 2020
Gaiak:	mitogenoma secuenciación de siguiente generación (NGS) secuenciación masiva lenguado de California Paralichthys californicus mitogenome next-generation sequencing (NGS) mass sequencing California halibut
Sarrera elektronikoa:	https://www.cienciasmarinas.com.mx/index.php/cmarinas/article/view/3121
Etiketak:	Etiketa erantsi Etiketarik gabe, Izan zaitez lehena erregistro honi etiketa jartzen!

id	repositorioinstitucional-20.500.12930-7589
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spelling	repositorioinstitucional-20.500.12930-75892023-05-09T14:30:27Z Complete mitochondrial genome of the California halibut, Paralichthys californicus Genoma mitocondrial completo del lenguado de California, Paralichthys californicus Vargas-Peralta, Carmen E Farfán, Claudia Lafarga-De La Cruz, Fabiola Barón-Sevilla, Benjamín Del Río-Portilla, Miguel A mitogenoma secuenciación de siguiente generación (NGS) secuenciación masiva lenguado de California Paralichthys californicus mitogenome next-generation sequencing (NGS) mass sequencing California halibut Paralichthys californicus The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work presents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina platform. Reads were cleaned, trimmed, assembled de novo, and annotated. The California halibut mitogenome is 16,858 bp in length (GenBank accession number: MT859134), containing 13 protein-coding genes, 22 tRNAs, 2 rRNAs, and the control region. P. californicus mitogenome was most similar to Paralichthys olivaceus than to other flatfish mitogenomes, in agreement with their geographic distribution. This information deepens the knowledge of the California halibut, which is not only ecologically important, but also a socioeconomically relevant resource for fishery and aquaculture in California, USA, and Baja California, Mexico. El lenguado de California, Paralichthys californicus, es una especie de pez plano con un alto valor econónico debido a su tamaño y a la calidad de su carne. En este trabajo se presenta el genoma mitocondrial completo de P. californicus. Se extrajo ADN total de tejido muscular y se secuenció utilizando la plataforma Illumina. Las lecturas obtenidas se limpiaron, se recortaron, se ensamblaron de novo y se anotaron. El mitogenoma del lenguado de California tiene una logitud de 16,858 pb (número de acceso del GenBank: MT859134) y contiene 13 genes codificadores de proteínas, 22 ARNt, 2 ARNr y la región control. El mitogenoma de P. californicus fue más similar al de Paralichthys olivaceus que a mitogenomas de otros peces planos, en concordancia con su distribución geográfica. La información aquí presentada incrementa el conocimiento del lenguado de California, el cual no solo es una especie de importancia económica, sino también un recurso socioeconómico relevante para la pesquería y la acuicultura de California, EUA, y de Baja California, México. 2020-12-18 2021-06-03T03:55:46Z 2021-06-03T03:55:46Z info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-reviewed Article Artículo Arbitrado https://www.cienciasmarinas.com.mx/index.php/cmarinas/article/view/3121 10.7773/cm.v46i4.3121 https://hdl.handle.net/20.500.12930/7589 eng https://www.cienciasmarinas.com.mx/index.php/cmarinas/article/view/3121/420420512 Copyright (c) 2020 Ciencias Marinas application/pdf Iniversidad Autónoma de Baja California Ciencias Marinas; Vol. 46 No. 4 (2020); 297–306 Ciencias Marinas; Vol. 46 Núm. 4 (2020); 297–306 2395-9053 0185-3880
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description	The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work presents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina platform. Reads were cleaned, trimmed, assembled de novo, and annotated. The California halibut mitogenome is 16,858 bp in length (GenBank accession number: MT859134), containing 13 protein-coding genes, 22 tRNAs, 2 rRNAs, and the control region. P. californicus mitogenome was most similar to Paralichthys olivaceus than to other flatfish mitogenomes, in agreement with their geographic distribution. This information deepens the knowledge of the California halibut, which is not only ecologically important, but also a socioeconomically relevant resource for fishery and aquaculture in California, USA, and Baja California, Mexico.
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Complete mitochondrial genome of the California halibut, Paralichthys californicus

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